一般来说，左侧及右侧的肝内胆管及其分支，在汇管区内的行程比较恒定，但其引流的范围和汇合的方式，有很大的个体差异。肝门部胆管的解剖主要是受右肝管变异的影响，较少的来自左肝管变异。典型的左右肝管同时变异只见于少数病例。

肝门区内第一级肝胆管的解剖与胆道外科关系最为密切。右肝管的长度短于左肝管，其平均长度为0.84cm。最常见的右肝管的解剖学变异是无右肝管，亦即是肝右叶的段肝管分别开口于肝总管，不形成主要的右肝管，或称为分裂型。由右后和右前段肝管汇合成典型的右肝管的规则型一般约占50%左右。

左肝管位于肝门横沟内的左侧，多由左外叶胆管和左内叶胆管汇合而成。从其汇合点至总肝管的长度平均为1.4～1.7cm，比右肝管长。左肝管在肝门部的位置比较恒定，很少无左肝管，但左内叶段肝管与左肝管汇合的解剖变异较为常见。